feat: 各步骤产物改为原子化落盘，复用前校验 .done 完成标记

跳过条件从 Path.exists() 改为 is_file_complete()，产物成功落盘后统一补 mark_file_complete()。涉及 step1 水域掩膜、step3 去耀斑、SHP 栅格化缓存三处快路径。

step3 去耀斑新增清理分支：无 .done 标记的旧文件一律视为半成品，先删除再重跑（Kutser/Goodman/Hedley/SUGAR 四种方法一致）。

模型落盘改为 atomic_filepath：modeling_batch 批量建模与 automl_trainer 的 AutoML 结果均先写 .__wip 再原子替换，避免中断产生半个 joblib 文件。

src/core/modeling/modeling_batch.py

@@ -824,7 +824,9 @@ class WaterQualityModelingBatch:
             'metadata': metadata
         }
 
-        joblib.dump(save_data, filepath)
+        from src.utils.util import atomic_filepath
+        with atomic_filepath(str(filepath)) as _tmp:
+            joblib.dump(save_data, _tmp)
         print(f"模型已保存: {filepath}")
 
         # ═══════════════════════════════════════════════════════════